![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
le_raДавно ничего сюда не писал - все работа и работа.
Вот о ней и напишу. Не о всей и даже не основной, а так, об отдельном проекте, в который я некоторым образом влез фактически на общественных началах. В качестве приземленного аналога "центаврианской биофлешки"!
У Громыко в "космо..олухах" есть описание такого девайса, похожего на блоху, назначение которого - собирать пробы генетического материала в биосфере исследуемой планеты "кусая" все подряд формы жизни, попадающиеся на пути. Смысл сего действа - в короткий срок (с применением большого числа биофлешек) собрать образцы генов всех существ, обитающих на данной территории.
Точно такую задачу преследует и текущий (вполне реальный) проект АBOL (Austrian Barcoding Of Life). То есть имеется идея собрать образцы генетического материала всех видов растений, животных и грибов, встречающихся на территории Австрии.
Генный материал сразу отправляйется на секвенцирование, причем к каждой пробе хоть тушкой, хоть чучелком, хоть гербарным листом для "вечного" хранения прилагается тот индивидуум, у которого пробу собственно и взяли. По один-два экземпляра с вида. Вроде не много, но в австрийской флоре только покрытосеменных больше 4000, а про насекомых я вообще молчу.
Когда я в первый раз услышал о проекте, то первая же мысль в голове была "Хочу центаврианскую биофлешку!"
Не знаю как у вас, а у меня в жизни уже пару раз случались такие моменты, когда есть четкое осознание потребности в неком приборе или устройстве, даже представление о том, как этот прибор должен выглядеть и работать, но поиски по каталогам быстро приводят к печальному факту о том, что сей девайс еще не изобретен. Так в середине девяностых совершенно угробив глаза чтением с компьютерного монитора я упорно искал и не находил некий мелкий и примитивный аналог размером с карманную брошюрку или видеокассету, предназначеный только и исключительно для чтения текстов. Десять лет спустя (ура изобретателю электронных чернил Джозефу Якобсону!) он у меня появился.
До конструкции, подобной центаврианской флешке, современной науке понадобится еще минимум пара десятилетий, так что пока приходится делать все вручную. А это все равно, что считать на счетах и читать НФ про умный прибор калькулятор.
К тому же в очередной раз дает о себе знать пропасть между белыми, лабораторнымимышами биологами, которые расшифровывают пробы ДНК и зелеными полевыми мышами биологами, которые эти пробы собирают. Чтобы не собирать одни и те же виды по десять раз и главное правильно узнавать их в естественных условиях нужны опытные, видавшие виды дарвины, которых при современной системе естественнонаучного образования остается все меньше и меньше. Я стараюсь собирать для ABOL как раз "сложные" группы - злаки, осоки. Мой шеф - сообразно его интересам и научным преференциям - мелкие желтые крестоцветные. Есть еще несколько "фриков" для отдельных групп организмов.
И ведь скорее всего этим своим проектом мы лишь приближаем день, когда знания подобные моим вообще перестанут быть нужны. Потому что любой обыватель гуляя по лесу или лугу сможет ткнуть портативным "молекулярным определяльником" в понравившийся ему цветочек и прибор, сравнив ДНК объекта с базой данных, выдаст исчерпывающую информацию о нем.
Вот о ней и напишу. Не о всей и даже не основной, а так, об отдельном проекте, в который я некоторым образом влез фактически на общественных началах. В качестве приземленного аналога "центаврианской биофлешки"!
У Громыко в "космо..олухах" есть описание такого девайса, похожего на блоху, назначение которого - собирать пробы генетического материала в биосфере исследуемой планеты "кусая" все подряд формы жизни, попадающиеся на пути. Смысл сего действа - в короткий срок (с применением большого числа биофлешек) собрать образцы генов всех существ, обитающих на данной территории.
Точно такую задачу преследует и текущий (вполне реальный) проект АBOL (Austrian Barcoding Of Life). То есть имеется идея собрать образцы генетического материала всех видов растений, животных и грибов, встречающихся на территории Австрии.
Генный материал сразу отправляйется на секвенцирование, причем к каждой пробе хоть тушкой, хоть чучелком, хоть гербарным листом для "вечного" хранения прилагается тот индивидуум, у которого пробу собственно и взяли. По один-два экземпляра с вида. Вроде не много, но в австрийской флоре только покрытосеменных больше 4000, а про насекомых я вообще молчу.
Когда я в первый раз услышал о проекте, то первая же мысль в голове была "Хочу центаврианскую биофлешку!"
Не знаю как у вас, а у меня в жизни уже пару раз случались такие моменты, когда есть четкое осознание потребности в неком приборе или устройстве, даже представление о том, как этот прибор должен выглядеть и работать, но поиски по каталогам быстро приводят к печальному факту о том, что сей девайс еще не изобретен. Так в середине девяностых совершенно угробив глаза чтением с компьютерного монитора я упорно искал и не находил некий мелкий и примитивный аналог размером с карманную брошюрку или видеокассету, предназначеный только и исключительно для чтения текстов. Десять лет спустя (ура изобретателю электронных чернил Джозефу Якобсону!) он у меня появился.
До конструкции, подобной центаврианской флешке, современной науке понадобится еще минимум пара десятилетий, так что пока приходится делать все вручную. А это все равно, что считать на счетах и читать НФ про умный прибор калькулятор.
К тому же в очередной раз дает о себе знать пропасть между белыми, лабораторными
И ведь скорее всего этим своим проектом мы лишь приближаем день, когда знания подобные моим вообще перестанут быть нужны. Потому что любой обыватель гуляя по лесу или лугу сможет ткнуть портативным "молекулярным определяльником" в понравившийся ему цветочек и прибор, сравнив ДНК объекта с базой данных, выдаст исчерпывающую информацию о нем.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2017-06-29 02:16 pm (UTC)А "мелкие жёлтые крестоцветные" очень похоже на англоамериканскую аббревиатуру FYC, "чертовы жёлтые сложноцветные". Тоже, наверное, группа растений, от которой неспециалисту в ответ на вопрос "а что это такое?" хочется ругаться матом.
А к "молекулярному определяльнику" всё уже стремительно движется. Вот у нас в саду лук, значившийся как Allium zebdanense, при ближайшем рассмотрении оказывается чем-то не тем. Что дает наиболее надежный, точный и достаточно уже быстрый ответ на вопрос, что это за лук? Правильно, секвенирование на ITS.
no subject
Date: 2017-06-29 02:56 pm (UTC)no subject
Date: 2017-06-29 03:41 pm (UTC)Во-первых, работа таксономистов. Этот "хоть тушкой, хоть чучелком" экземпляр еще нужно достоверно определить (а сперва нормально сохранить, с признаками - а это не так просто для микроскопического гриба), работа не быстрая. Хотя вы свои 4000 австрийских покрытосеменных, думаю, переварите за несколько лет (не так и много - зря возмущается предыдущий комментатор; у вас Альпы, высотная поясность, гумидность, некоторая зональность/провинциальность, изучен каждый метр по сравнению, скажем, с Гобийским Алтаем или не дай бог с горами Новой Гвинеи, и т.д.)
Да, второе. Не всегда возможно в нашей насекомой области собирать виды выборочно. Часто используются только массовые методы сбора - лов на свет, почвенные ловушки... Среди тысяч экз. нескольких "банальных видов" попадаются единицы "оригинальных видов", которые, собственно, и составляют биоразнообразие данной территории. Опять работа для систематика, и не для всякого - "навозну кучу разгребая, петух нашел жемчужное зерно", не всякий петух на это клюнет. Выгодней бывает пустить одного систематика, который адекватно соберет свою группу - их эффективнейший результат работы я многажды видел.
В-третьих, насекомых просто очень много! А людей, которые их знают - мало! Большинство семейств жуков (добавьте почти отряд беспозвоночных по вкусу) просто никто не умеет определять! Во всем мире. Просто есть модные группы.
Еще прикол. Не в-четвертых, а так. БОльшая часть новых видов насекомых (примерно 60% из примерно 10 тысяч, описываемых каждый год) описывается без каких-либо молекулярных изысканий, поскольку работа эта делается любителями, которым недоступен анализ ДНК. И слава богу, хоть так обозреть биоразнообразие.
Короче, всё это ужасно. Не будет на нашем веку автоматической блохи.
А что делать. "Ино ещё побредём."
мы все эльфы, только из разных переводов!
Date: 2017-06-29 04:06 pm (UTC)Но когда получается, что Австрия уделывает богатством флоры Армению, Турцию и едва ли не Капскую флористическую область, ощущения странные.
Re: мы все эльфы, только из разных переводов!
Date: 2017-06-29 04:23 pm (UTC)Re: мы все эльфы, только из разных переводов!
Date: 2017-06-29 04:43 pm (UTC)Сухость, КМК, зачастую не препятствует, а способствует видообразованию, за счёт возникновения дополнительных "островов" с микроклиматом, как во всех средиземноморских климатах.
Приобрёл тут недавно красивую книжку "Bulbous plants of Turkey and Iran", из неё создалось четкое впечатление, что европейские ботаники, с удовольствием сидя в курортной гостеприимной Турции, описывали десятки видов на материале, которому в закрытом Иране соответствует два-три очень генерализованных вида, описанных в начале двадцатого века.
Re: мы все эльфы, только из разных переводов!
Date: 2017-06-30 05:27 am (UTC)Bulbous plants of Turkey and Iran у нас есть в библиотеке. В университете Вены тоже были свои фрики по луковичным средиземноморья, которые внесли туда свою лепту. Но я с ними практически не пересекался.
no subject
Date: 2017-06-30 05:42 am (UTC)Pictures from collective networks
Date: 2017-07-05 11:30 pm (UTC)http://asia.dating.adultnet.in/?entry.alessandra
louisiana political porn start candidate free women fuckin horse porn paulina james porn vintage porn seka canyon skinny bdsm porn tube
My new website
Date: 2017-07-27 10:13 pm (UTC)http://arab.egypt.adultnet.in/?entry.rachael
saxiixul surveillance type moon damon